乙肝抗病毒的一般适应证如下：
HBeAg阳性者，HBV—DNA≥105copy/ml（相当于20000IU/ml）；HBeAg阴性者，HBV—DNA≥104copy/ml（相当于2000IU/ml）。
ALT≥2×ULN；如用干扰素治疗，ALT应≤10×ULN，血清总胆红素应＜2×ULN。
ALT＜2×ULN，但肝组织学显示KnodellHAI≥4，或炎症坏死≥G2，或纤维化≥S2。
对持续HBV—DNA阳性，达不到上述治疗标准，但有以下情形之一者，亦应考虑给予抗病毒治疗：
对ALT大于正常上限且年龄＞40岁者，也应考虑抗病毒治疗。
对ALT持续正常但年龄较大者（＞40岁），应密切随访，最好进行肝活检；如果肝组织学显示KnodellHAI≥4，或炎症坏死≥G2，或纤维化≥S2，应积极给予抗病毒治疗；
动态观察发现有疾病进展的证据（如脾脏进化性增大）者，建议行肝组织学检查，必要时给予抗病毒治疗。
在开始治疗前应排除由药物、酒精或其他因素所致的ALT升高，也应排除应用降酶药物后ALT暂时性正常。在一些特殊病例如肝硬化或服用联苯结构衍生物类药物者，其AST水平可高于ALT，此时可将AST水平作为主要指标。
初始药物的选择应综合考虑药物疗效、安全性、耐药风险、患者依从性及费用可承受性，这些是长期管理成败的关键。治疗中的监测同样包括疗效、安全性、耐药、依从性等方面。一旦监测结果异常，应当及时进行深入评估分析，并予以相应的挽救治疗。
对于乙肝相关肝硬化抗病毒的治疗，其目的在于抑制HBV复制，从而抑制或阻止肝硬化病情继续进展，延缓或阻抑肝硬化由代偿期向失代偿期发展，缓解失代偿期肝硬化病情的进一步恶化，降低肝癌的发生风险，延长等待肝移植的时间甚或避免肝移植，延长患者的生存期，改善生活质量。许多临床研究资料证明，核苷类药物治疗可改善代偿期和失代偿期肝硬化患者的临床结局，即使是中晚期肝硬化，其肝功能也可以在有效的抗病毒治疗后得以改善。
